سازمان ساختاری از سطوح مولکول پروتئین: ساختار دوم پروتئین

اساس ساختار پروتئین ها و proteids از زنجیره پلی پپتیدی و یک مولکول پروتئینی ممکن است از یک، دو یا چند مدار تشکیل شده است. با این وجود، خواص فیزیکی، بیولوژیکی و شیمیایی پلیمرهای زیستی هستند نه تنها باعث یک ساختار شیمیایی به طور کلی که ممکن است یک "بی معنی"، بلکه با سایر سطوح سازمان از مولکول پروتئین است.

ساختار اولیه از یک پروتئین است ترکیب اسید آمینه کمی و کیفی تعیین می شود. اوراق قرضه پپتید اساس ساختار اولیه هستند. برای اولین بار این فرضیه پیشنهاد در سال 1888 A. بله. Danilevsky، و بعد از سوء ظن خود را با سنتز پپتید است که توسط E. فیشر انجام تایید شد. ساختار مولکول های پروتئین به تفصیل بررسی A. بله. Danilevskim و E. فیشر. بر اساس این نظریه، مولکول های پروتئین را از تعداد زیادی از باقی مانده اسید آمینه که توسط اوراق قرضه پپتید متصل است. مولکول پروتئین ممکن است یک یا چند زنجیره پلی پپتیدی است.

هنگامی که ساختارهای اولیه از پروتئین برای عوامل آزمون های شیمیایی و آنزیم های پروتئولیتیک استفاده می شود. بنابراین، با استفاده از روش ادمان بسیار مناسب برای شناسایی اسیدهای آمینه ترمینال است.

ساختار دوم پروتئین یک پیکربندی فضایی مولکول پروتئینی را نشان می دهد. به شرح زیر است نوع ساختار ثانویه وجود دارد: آلفا مارپیچ، بتا مارپیچ، مارپیچ کلاژن است. دانشمندان دریافته اند که مشخصه بسیاری از ساختار آلفا مارپیچ از پپتیدهای.

ساختار دوم پروتئین با استفاده تثبیت پیوند هیدروژنی. دومی بین بوجود می آیند اتم هیدروژن متصل به یک اتم نیتروژن الکترونگاتیو یک پیوند پپتیدی و اتم اکسیژن کربونیل از یک چهارم از اسیدهای آمینه آن، و آنها را در امتداد مارپیچ است. محاسبات نشان می دهد که انرژی پلیمریزاسیون از این اسیدهای آمینه کارآمد تر راست آلفا مارپیچ، در حال حاضر در پروتئین های بومی است که است.

ساختار دوم پروتئین: ساختار بتا ورق

زنجیره پلی پپتیدی در بتا برابر به طور کامل گسترش داده است. بتا برابر در اثر تداخل دو زنجیره پپتیدی تشکیل شده است. این ساختار مشخصه است پروتئین فیبردار (کراتین، fibroin، و غیره). به طور خاص، بتا کراتین است که با یک آرایش موازی زنجیره پلی پپتیدی است که بیشتر توسط interchain پیوندهای دی سولفید تثبیت شده است. زنجیره پلی پپتیدی fibroin ابریشم همسایه نامتناظر است.

ساختار دوم پروتئین: مارپیچ کلاژن

تشکیل متشکل از سه زنجیره tropocollagen spiralized، که دارای یک شکل میله. Spiralized حلقه زنجیره و به شکل یک superhelix. مارپیچ بین هیدروژن از پپتید رخ آمینه مانده اسید آمینه ها در یک زنجیره و اکسیژن گروه کربونیل از باقی مانده اسید آمینه های زنجیره ای دیگر تثبیت شده توسط پیوند هیدروژنی. ساختار کلاژن ارائه می دهد قدرت بالا و انعطاف پذیری.

ساختار سوم پروتئین

ترین پروتئین ها در حالت خالص ساختار بسیار جمع و جور است که توسط شکل، اندازه، و قطب رادیکال اسید آمینه، و توالی اسید آمینه تعیین می شود.

تأثیر قابل توجهی در شکل گیری ساختار پروتئین بومی، یا یک ساختار سوم تعاملات آبگریز و یونی، پیوند هیدروژنی، و غیره. تحت عمل این نیروها است ساختار ترمودینامیکی مصلحت از مولکول پروتئین و تثبیت آن به دست آورد.

ساختار چهارتایی

این نوع از ساختار مولکول در نتیجه ارتباط چند زیر واحد را به یک مجموعه تک مولکول است. ترکیب هر زیر واحد شامل ساختارهای ابتدایی، متوسطه و عالی.